Στο θεσμό του Κυπέλλου ΕΠΣ ΡΕΘΥΜΝΟΥ συμμετέχουν (19) ομάδες που είναι οι εξής:
1. ΑΟ ΕΠΙΣΚΟΠΗΣ
2. ΑΕ ΜΥΛΟΠΟΤΑΜΟΥ
3. ΕΡΜΗΣ ΖΩΝΙΑΝΩΝ
4. ΡΕΘΥΜΝΙΑΚΟΣ ΑΟ
5. ΑΟΝ ΑΣΤΕΡΑΣ
6. ΑΟ ΚΑΛΥΒΟΥ
7. ΟΦ ΑΡΜΕΝΩΝ
8. ΑΟ ΑΡΗΣ ΡΕΘΥΜΝΟΥ
9. ΑΕ ΑΤΣΙΠ-ΠΡΙΝΕ
10. ΤΑΛΩΣ ΜΕΛΙΔΟΝΙΟΥ
11. ΑΟ ΨΗΛΟΡΕΙΤΗΣ
12. ΠΑΟ ΑΛΦΑΣ
13. ΑΟ ΠΟΣΕΙΔΩΝ ΓΕΡΑΝ
14. ΑΟ ΛΙΒΑΔΙΩΝ
15. ΑΣΤΕΡΑΣ ΠΕΡΑΜΑΤΟΣ
16. ΝΕΑΡ
17. ΑΟ ΣΠΗΛΙΟΥ
18. ΦΛΟΓΑ ΡΟΥΣΤΙΚΩΝ
19. ΑΟ ΕΠΙΣΚΟΠΗΣ 2010